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　　黑斑原鮡是雅魯藏布江中游特有種，也是雅魯藏布江8種鮡科魚類中*在中游（雅魯藏布江謝通門江段下至支流尼洋河及中游支流拉薩河的唐加至扎雪河段）分布的種，其分布海拔高度在2800米－4200米之間。近日，自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所聯(lián)手諾禾致源及武漢理工大學，公布了*青藏高原特有魚類黑斑原鮡的基因組，這意味著填補了青藏高原魚類基因組空白，為后期種質(zhì)資源保護和魚類適應性研究奠定了基礎。

　　通過近半年反復推敲

　　*終確認黑斑原鮡基因組版本

　　據(jù)悉，黑斑原鮡腹腔內(nèi)除了具有正常的肝臟外，在皮膚與體壁肌肉之間分生出一個與腹腔內(nèi)肝臟連接的相同功能的組織——腹腔外肝，但目前對于黑斑原鮡特殊的肝臟發(fā)育分子機制及其在適應性進化中的生理功能變化情況尚不清楚。

　　2008年，自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所劉海平博士對采自雅魯藏布江林芝江段和日喀則江段的黑斑原鮡的外部形態(tài)和骨骼系統(tǒng)進行了研究，發(fā)現(xiàn)兩者并不存在差異。但是查閱相關資料可以發(fā)現(xiàn)，一直以來，黑斑原鮡染色體組型上的研究都存在爭議。

　　作為西藏特有的珍稀土著魚類，黑斑原鮡資源量日漸衰退。與此同時，其市場價也在一路飆升，甚至出現(xiàn)了一魚難求的現(xiàn)象。自2016年以來，自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所工作人員在黑斑原鮡曾經(jīng)有分布的拉薩河連續(xù)嘗試捕撈，但沒有采集到一尾黑斑原鮡。面對這樣的情況，青海提出要對黑斑原鮡進行資源保護，加大對黑斑原鮡的養(yǎng)護進程，刻不容緩。

　　同年11月，自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所得到西藏財政專項“黑斑原鮡種質(zhì)資源保護與基因技術開發(fā)研究”的支持后，著手開展項目設定的相關內(nèi)容。在歷時近半年的野外采樣任務中，科研人員從雅魯藏布江拉孜縣江段采集本項目需要的組織和環(huán)境樣本。2017年4月，開始進行基因組提取、測序和分析工作，從肌肉組織中提取總基因組DNA進行并啟動建庫、測序和分析工作，共得到603.99Gb高質(zhì)量基因組數(shù)據(jù)。“中間經(jīng)歷了基因組初步組裝和驗證等分析工作，通過近半年的反復推敲，我們才*終確認了黑斑原鮡基因組版本。”劉海平博士告訴記者。

　　2018年8月14日，自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所聯(lián)手諾禾致源及武漢理工大學，公布了*青藏高原特有魚類黑斑原鮡的基因組。

　　擁有黑斑原鮡基因組

　　有望為特色魚類繁育提供技術

　　黑斑原鮡基因組的公布，是世界上*青藏高原魚類的基因組，表明我國在青藏高原魚類基因組研究領域取得了階段性成果，這為學界和養(yǎng)殖行業(yè)都提供了寶貴的遺傳資源。“由于這個基因組是使用*新的三代測序和數(shù)據(jù)分析方法完成的，可表明青海基因組研究也進入到世界先進水平。”自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所劉啟勇書記說。

　　黑斑原鮡基因組的成功解析，也將大大促進青海黑斑原鮡種質(zhì)資源養(yǎng)護實踐和特色魚類生物多樣性的研究。據(jù)記者了解，以前的群體研究使用了線粒體和少數(shù)幾個基因進行的群體分析，而現(xiàn)在可以在基因組基礎上對全基因組的標記進行分析，為更加全面和深入地研究黑斑原鮡的生物多樣性，徹底摸清青海原生鮡科魚類的“家底”提供了參考。這些研究不僅可以為青海黑斑原鮡養(yǎng)護政策提供更加可靠的理論依據(jù)，也為相關的種質(zhì)資源現(xiàn)狀調(diào)查和預測提供更加堅實的基礎。

　　那么，基因組的發(fā)現(xiàn)，對于人工繁殖技術是否有很大的推動作用呢？為此，記者也進行了了解。基因組包含了生物是細胞內(nèi)一個生物的所有遺傳信息的綜合，這些遺傳信息以核苷酸序列形式存儲在細胞核內(nèi)。擁有了黑斑原鮡的基因組，就為后續(xù)關于黑斑原鮡的分子生物學所有研究和應用奠定了基礎，包括繁殖育種領域。

　　“一方面，基因組的連續(xù)性和完整性都達到了非常高的水平，便于在后續(xù)研究中定位到重要經(jīng)濟性狀相關的基因，比如繁殖力、生長速度、性別控制等方面，這些研究結果可以進行輔助選種，提供育種和繁殖過程中人工選擇效率，提高養(yǎng)殖農(nóng)戶的經(jīng)濟收入。另一方面，基因育種是水產(chǎn)養(yǎng)殖育種的重要方向，我們解析的黑斑原鮡參考基因組就為這個技術在青海冷水養(yǎng)殖應用中掃清了障礙，我們會在這個參考基因組的基礎上進行相關研究，有可能為青海特色魚類繁育提供新的技術。”自治區(qū)農(nóng)科院水產(chǎn)所所長牟振波說道。

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