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光合細菌是一類能進行光合作用的細菌，即在光照條件下，利用水中的氨氮、亞硝態氮、硫化氫和各種有機物進行光合作用，進而消除這些有害物質對魚類造成的負面影響，為魚類營造良好的水域環境。　　
一、光合細菌養魚優點　　
（一）凈化水質近年來，隨著水產養殖業的發展，水產養殖單位產量大幅度提高，但水質污染嚴重，特別是飼養后期，水中有機物、氨及亞硝酸鹽含量偏高，嚴重影響了魚的生長。光合細菌施入水體后，它可降解水體中的殘存飼料、魚類的糞便及其它有機物；同時，還能吸收利用水體中的氨、亞硝酸鹽、硫化氫等有害物質。施用光合細菌，能有效避免固體有機物和有害物質的積累，起到凈化水質的作用。
（二）作為魚苗的開口飼料和飼料添加劑 光合細菌是一種營養豐富、營養價值高的細菌，菌體含有豐富的氨基酸、葉酸、b族維生素，尤其是維生素b12和生物素含量較高，還有生理活性物質輔酶Q。光合細菌的體積為小球藻的二十分之一，特別適合作為剛孵出仔魚的開口餌料。使用光合細菌作為開口餌料，可大幅度提高魚苗成活率。光合細菌還可作為飼料添加劑添加在飼料中，光合細菌所含的酶類，可以促進魚類對飼料的消化吸收，提高飼料利用率，降低餌料系數，同時還可顯著提高魚的生長速度。　　
（三）減少魚類病害的發生 光合細菌施入水體后，迅速繁殖成為水體中的優勢細菌種群，既改善了水質，又抑制了有害病菌的生長和繁殖，降低了有害病菌數量，從而減少了魚類病害的發生。光合細菌的防病效果非常有效。
（四）培養有益藻類 水體中施入光合細菌后，硅藻、小球藻等魚類喜歡攝食的藻類成為優勢藻類，而藍藻等有害藻類受到抑制。光合細菌能大量利用水中的氨氮，能有效避免“水華”的產生，如藍藻的大量繁生。