上海零珊果蔬專業合作社擁有完善的組織機構。合作社下設策劃聯絡部、技術服務部、市場開發部、物資供應部及財務部等5個部門，每個部門都有專職經理負責，各司其職，密切配合。 合作社通過吸納社會上經驗豐富的人才，組成穩定的營銷團隊，為合作社拓展銷售業務。同時還招收了一些有電子商務知識的大學生，進行網絡銷售。